Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Sh3bp2Q06649 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Sh3bp2Q06649 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Sh3bp2Q06649 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sh3bp2Q06649 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms