Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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Hoxd9P28357 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Hoxd9P28357 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd9P28357 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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