Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ggta1P23336 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ggta1P23336 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ggta1P23336 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ggta1P23336 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ggta1P23336 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ggta1P23336 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ggta1P23336 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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