Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccl20O89093 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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Ccl20O89093 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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