Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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