Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Casq1O09165 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Casq1O09165 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Casq1O09165 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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