Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Grik3B1AS29 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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