Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms