Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Cln8Q9QUK3 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cln8Q9QUK3 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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