Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Col5a3Q9JLI2 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Col5a3Q9JLI2 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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