Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Usp27Q8CEG8 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms