Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ssbp4Q3U4B1 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ssbp4Q3U4B1 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ssbp4Q3U4B1 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Ssbp4Q3U4B1 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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