Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms