Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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Sh3bp1P55194 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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Sh3bp1P55194 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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Sh3bp1P55194 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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Sh3bp1P55194 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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Sh3bp1P55194 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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Sh3bp1P55194 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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Sh3bp1P55194 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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Sh3bp1P55194 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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Sh3bp1P55194 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Sh3bp1P55194 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms