Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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VdrP48281 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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VdrP48281 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VdrP48281 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
VdrP48281 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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