Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm24201-201ENSMUST00000082946 125 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd11P23813 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms