Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Cldn4O35054 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn4O35054 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn4O35054 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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