Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
H2-Q1O19441 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
H2-Q1O19441 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms