Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rabgef1Q9JM13 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms