Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Col5a3Q9JLI2 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms