Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Irx5Q9JKQ4 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Irx5Q9JKQ4 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms