Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Apobec3Q99J72 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms