Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Snx8Q8CFD4 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms