Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp27Q8CEG8 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms