Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Cpne9Q1RLL3 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms