Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx1P81068 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Irx1P81068 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms