Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms