Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PtpreP49446 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PtpreP49446 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms