Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
VdrP48281 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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VdrP48281 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
VdrP48281 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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