Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Usp9yF8VPU6 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Usp9yF8VPU6 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms