Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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