Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Col4a3Q9QZS0 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col4a3Q9QZS0 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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