Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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Limd1Q9QXD8 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Limd1Q9QXD8 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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