Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Col5a3Q9JLI2 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Col5a3Q9JLI2 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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