Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm24926-201ENSMUST00000178053 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm22632-201ENSMUST00000178266 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fcf1Q9CTH6 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms