Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Vipas39Q8BGQ1 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Vipas39Q8BGQ1 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Vipas39Q8BGQ1 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Vipas39Q8BGQ1 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Vipas39Q8BGQ1 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Vipas39Q8BGQ1 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Vipas39Q8BGQ1 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Vipas39Q8BGQ1 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Vipas39Q8BGQ1 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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Vipas39Q8BGQ1 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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Vipas39Q8BGQ1 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Vipas39Q8BGQ1 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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