Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23278-201ENSMUST00000157911 143 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NipblQ6KCD5 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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