Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gtpbp6Q3U6U5 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25382-201ENSMUST00000157811 97 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Gtpbp6Q3U6U5 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms