Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Trim71Q1PSW8 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Trim71Q1PSW8 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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