Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Sh3bp1P55194 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sh3bp1P55194 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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