Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VdrP48281 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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VdrP48281 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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VdrP48281 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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VdrP48281 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
VdrP48281 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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