Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
PtprmP28828 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PtprmP28828 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms