Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RxraP28700 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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