Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd11P23813 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms