Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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Ccl20O89093 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccl20O89093 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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