Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
MttpO08601 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
MttpO08601 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
MttpO08601 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms