Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Smim18J3QNP2 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms