Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Ccdc39Q9D5Y1 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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