Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NipblQ6KCD5 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NipblQ6KCD5 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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