Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Ssbp4Q3U4B1 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Ssbp4Q3U4B1 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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